. 2013; 47(1): 26-32 | DOI: 10.4274/turkderm.82435 | |||
The place of molecular methods in the identification of dermatophytes and the determination of their feasibilityFatma Bıyık1, Yvonne Gräser2, Serdar Susever1, Güzin Özarmağan3, Yıldız Yeğenoğlu11Medical Faculty Of Istanbul, Department Of Medical Microbiology, Istanbul, Turkey2Institut Für Mikrobiologie Und Hygiene Der Humboldt Universität Berlin, Germany 3Medical Faculty Of Istanbul, Department Of Dermatology, Istanbul, Turkey Background and Design: Unlike opportunistic fungi, dermatophytes cannot be isolated on the conventional culture media in a few days. Their growing periods cover approximately two weeks in a suitable media and identification are made with conventional methods as typical macroscopic and microscopic appearance. However, successful results are not always obtained with the phenotypic features, and thus, diagnostic problems and delay in diagnosis and treatment may arise. For this reason, the methods based on nucleic acid amplification have been necessary. In this study, we aimed to identify 56 dermatophytes strains, which were identified by conventional methods, by molecular methods and to investigate the correlation between the two methods and to determine the usability of molecular methods in routine laboratories. Dermatofitlerin identifikasyonunda moleküler yöntemlerin yeri ve uygulanabilirliğinin belirlenmesiFatma Bıyık1, Yvonne Gräser2, Serdar Susever1, Güzin Özarmağan3, Yıldız Yeğenoğlu11İstanbul Üniversitesi İstanbul Tıp Fakültesi, Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, İstanbul, Türkiye2Humboldt Universitesi, Mikrobiyoloji Ve Hijyen Enstitüsü, Berlin, Almanya 3İstanbul Üniversitesi İstanbul Tıp Fakültesi, Deri Ve Zührevi Hastalıklar Anabilim Dalı, İstanbul, Türkiye Amaç: Dermatofitler geleneksel izolasyon besiyerlerinde fırsatçı mantarlar gibi birkaç günde izole edilemezler. Uygun ortamda üreme süreleri yaklaşık olarak iki haftayı kapsar ve identifikasyonunda tipik makroskopik, mikroskopik özellikler ve biyokimyasal testler gibi geleneksel yöntemlerden yararlanılır. Ancak fenotipik özellikler ile her zaman başarılı sonuçların alınamayışı, bu nedenle tanı ve tedavide oluşabilecek gecikme ve sorunlar, nükleik asit amplifikasyon temeline dayalı yöntemlerden yararlanmayı gerekli kılmıştır. Bu çalışmada geleneksel yöntemler ile identifikasyonu yapılan 56 dermatofit suşunun moleküler yöntemlerle de identifiye edilerek her iki yöntemin birbirleriyle uyum derecelerinin araştırılması ve moleküler yöntemlerin rutin laboratuvarlarda kullanılabilirliklerinin belirlenmesi amaçlanmıştır. Fatma Bıyık, Yvonne Gräser, Serdar Susever, Güzin Özarmağan, Yıldız Yeğenoğlu. The place of molecular methods in the identification of dermatophytes and the determination of their feasibility. . 2013; 47(1): 26-32 Corresponding Author: Serdar Susever, Türkiye |
|