Giardia intestinalis genotiplerinin, real-time PCR yöntemi ile dışkı örneklerinden tespiti
Mehmet Demirci1, Akın Yiğin2, Cemil Demir3, Düriye Pelin Acel41Beykent Üniversitesi Tıp Fakültesi, Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, Istanbul, Türkiye2Harran Üniversitesi Veteriner Fakültesi, Genetik Anabilim Dalı, Şanlıurfa, Türkiye
3Mardin Artuklu Üniversitesi Sağlık Hizmetleri Myo, Mardin, Türkiye
4Gaziantep Üniversitesi Tıp Fakültesi Hastanesi, Gaziantep, Türkiye
GİRİŞ ve AMAÇ: Giardia intestinalis flagellalı, giardiyaz’a neden olan bir protozoondur ve dünya çapında önemli bir sorundur. Moleküler yöntemlerle sekiz farklı genotipi saptanan G. intestinalis’de, A ve B genotipinin, insan ve memelilerde hastalıklarla ilişkili olduğu ve farklı genotiplerin, farklı klinik tablolar meydana getirebildiği bildirilmektedir. Bizde bu bilgiler ışığında, giardiyaz tanısı almış ve G. intestinalis pozitif saptanan dışkı örneklerinde bulunan G. intestinalis genotiplerinin dağılımını real-time PCR yöntemi ile belirlemeyi ve moleküler epidemiyolojik bir veri sunmayı amaçladık.
YÖNTEM ve GEREÇLER: Ocak 2016-Ocak 2018 tarihleri arasında, hem nativ, hem de lugol ile mikroskobik olarak incelenen dışkı örnekleri içinde G. intestinalis kist ve/veya trofozoit’i pozitif bulunan 50 G. intestinalis pozitif hastanın dışkı numuneleri çalışmaya dahil edildi. Dışkı örneklerinden DNA izolasyonu gerçekleştirildikten sonra genotip A ve genotip B için spesifik primerler kullanılarak real-time PCR ile analiz edildi.
BULGULAR: Çalışmamıza dahil edilen 50 giardiyaz tanılı hastanın dışkı örneklerinde, 28’inde (%56) A genotipi saptanırken, 17’sinde (%34) B genotipi ve 5’inde (%10) ise hem A, hemde B genotipi bulundu. Cinsiyete göre saptanan genotipler incelendiğinde erkeklerde ve bayanlarda sırasıyla 25 (%50) ve 25 (%50) olarak bulundu.
TARTIŞMA ve SONUÇ: Sonuç olarak çalışmamız ile ülkemizde giardiyaza neden olan ama ayrımı sadece moleküler yöntemlerle ortaya konabilen G. intestinalis genotipleri incelenerek, G. intestinalis’in A genotipinin, B genotipine oranla biraz daha fazla olduğu belirlendi. Ülkemizde G. intestinalis’in moleküler epidemiyolojisine yönelik veriler sınırlıdır. Bu çalışmanın buna katkı sağlayacağı kanaatindeyiz.
Determination of Giardia intestinalis assemblages from stool samples via real-time PCR method
Mehmet Demirci1, Akın Yiğin2, Cemil Demir3, Düriye Pelin Acel41Beykent University, School of Medicine, Department of Medical Microbiology, Istanbul, Turkey2Harran University, Veterinary Faculty, Department Of Genetic, Şanlıurfa, Turkey
3Mardin Artuklu University, Vocational School, Mardin, Turkey
4Gaziantep University Hospital, Gaziantep, Turkey
INTRODUCTION: Giardia intestinalis is a protozoa with flagellated, causing giardiasis, and is a major problem worldwide. In G. intestinalis, which identifies eight different assemblages via molecular methods, it is reported that the assemblage A and B are related to diseases in humans and mammals and others assemblages can cause different clinical tables. In this study, we aimed to determine the distribution of G. intestinalis assemblages in stool specimens of G. intestinalis positive patients by real-time PCR and to present a molecular epidemiological data.
METHODS: Between January 2016 and January 2018, stool samples from fifty G. intestinalis cysts and / or trophozoites positive patients were included. Stool specimens examined microscopically with both native and lugol. DNA isolation from stool specimens was performed and then analyzed by real-time PCR using specific primers for assemblage A and assemblage B.
RESULTS: In stool samples of fifty giardiasis patients included in our study, 28 (56%) were found assemblage A, 17 (34%) were found assemblage B and 5 (10%) were found both assemblages. When assemblages checked by sex, 25 (50%) and 25 (50%) were found in males and females respectively.
DISCUSSION AND CONCLUSION: In conclusion, we investigated G. intestinalis assemblages which cause giardiasis in our country but these assemblages can only be distinguished by molecular methods. we found that G. intestinalis assemblage A is slightly higher than assemblage B. In our country, the data on the molecular epidemiology of G. intestinalis assemblages is very limited. We believe this work will contribute to this.
Sorumlu Yazar: Mehmet Demirci, Türkiye
| ARAÇLAR |
 Tam Metin PDF Yazdır Alıntıyı İndir RIS EndNote BibTex Medlars Procite Reference Manager E-Postala Paylaş Yazara e-posta gönder
Benzer makaleler Google Scholar |