Trichosporon Türlerinin Tanımlanmasında Matriks aracılı lazer dezorpsiyon iyonizasyon-uçuş zamanlı-kütle spektrometresi (MALDI-TOF MS) Sisteminin API ID 32 C ve VITEK 2 ile Karşılaştırılması
Süleyman Pelit1, Gonca Erköse Genç1, Ayşe Barış2, Zayre Erturan11İstanbul Üniversitesi İstanbul Tıp Fakültesi, Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, İstanbul2Şişli Hamidiye Etfal Eğitim ve Araştırma Hastanesi, Mikrobiyoloji Laboratuvarı,İstanbul
GİRİŞ ve AMAÇ: Trichosporon türleri doğada geniş dağılım gösterir; insanlarda ise deri ve mukozada kolonize olabilen mayalardır. Trichosporon türlerinin neden olduğu invazif enfeksiyonlar yaygın olmamakla birlikte bağışıklık sistemi baskılanmış hastalarda sıklıkla fatal seyirlidir. Trichosporon türlerinin doğru identifikasyonu zor olmasına karşın uygun tedavi yaklaşımları açısından önemlidir. Fenotipik ve genotipik yöntemlere alternatif olarak Matriks aracılı lazer dezorpsiyon iyonizasyon-uçuş zamanlı-kütle spektrometresi (MALDI-TOF MS) hızlı ve doğru bir identifikasyon yöntemi olarak gündeme gelmektedir. Bu araştırmada çeşitli klinik örneklerden izole edilen Trichosporon cinsi mayaların MALDI-TOF MS (Bruker Daltonics, Bremen, Almanya) ile tür düzeyinde tanımlanması ve bu sonuçların rutin mikrobiyoloji laboratuvarlarında mayaların identifikasyonunda sıkça kullanılan API ID 32C (bioMérieux, Marcy I’Etoile, Fransa) ve Vitek 2 (bioMérieux, Marcy I’Etoile, Fransa) sistemleri ile karşılaştırılması amaçlanmıştır.
YÖNTEM ve GEREÇLER: Yoğun bakım hastalarından izole edilen ve konvansiyonel yöntemlerle cins düzeyinde tanımlanan toplam 45 Trichosporon suşu, MALDI-TOF MS, API ID 32C kiti ve Vitek 2 otomatize sistemi ile tanımlanmış ve sonuçlar karşılaştırılmıştır.
BULGULAR: Her üç sistem ile yapılan tanımlama tüm izolatlar için %100 uyumlu bulunmuştur. İzolatların 44 (% 97,8)’ü T. asahii, biri (% 2,2) ise T. mucoides olarak tanımlanmıştır.
TARTIŞMA ve SONUÇ: Buna göre MALDI-TOF MS yöntemi; invazif enfeksiyonlarda en sık rastlanan Trichosporon türü olan T. asahii’nin tanımlanmasında API ID 32C ve Vitek 2 ile aynı doğrulukta ancak daha hızlı ve kolay uygulanabilen bir yöntemdir ayrıca düşük maliyetli olması bir alternatif oluşturmaktadır.
Comparision of matrix-assisted laser desorption ionization-time of flight (MALDI-TOF MS) with API ID 32C and VITEK 2 for the identification of Trichosporon species
Süleyman Pelit1, Gonca Erköse Genç1, Ayşe Barış2, Zayre Erturan11Istanbul University, Istanbul Faculty of Medicine, Department of Medical Microbiology, Istanbul, Turkey2Sisli Hamidiye Etfal Training And Research Hospital, Microbiology Laboratory, Istanbul, Turkey
INTRODUCTION: Trichosporon species have a widespread distribution and human skin and mucosa can be colonized with Trichosporon species. Invasive infections caused by Trichosporon species are uncommon but frequently fatal in immunocompromised patients. Correct and rapid identification to the species level of Trichosporon is challenging but important for appropriate treatment approches. As an alternative to phenotypic and genome-based identification techniques, Matrix-assisted laser desorption ionization-time of flight (MALDI-TOF) mass spectrometry (MS) is emerging as a rapid and accurate identification method. In this study we aimed to evaluate MALDI-TOF MS (Bruker Daltonics, Bremen, Germany) for the identification of Trichosporon species and compare with API ID 32C (bioMérieux, Marcy I’Etoile, France) and Vitek 2 (bioMérieux, Marcy I’Etoile, France).
METHODS: A total of 45 Trichosporon strains that isolated from intensive care unit patients and identified by convantional methods at the genus level, were identified by MALDI TOF MS, API ID 32C and Vitek 2 and the results were compared.
RESULTS: All systems yielded fully concordant results for all of the isolates. Forty four (97.8%) of the 45 isolates were identified as T. asahii and one (2.2%) isolate was identified as T. mucoides.
DISCUSSION AND CONCLUSION: The MALDI TOF MS method was found to be a valuable alternative tool for identifying T. asahii with low consumable costs and rapid identification possibility.
Sorumlu Yazar: Süleyman Pelit, Türkiye
| ARAÇLAR |
 Tam Metin PDF Yazdır Alıntıyı İndir RIS EndNote BibTex Medlars Procite Reference Manager E-Postala Paylaş Yazara e-posta gönder
Benzer makaleler Google Scholar |