Investigation of antimicrobial susceptibility profile, virulence genes and epidemiological relationship of clinical Salmonella isolates Short title: Susceptibility and virulence in Salmonella isolates
Yamaç Tekintaş1, Fethiye Ferda Yılmaz2, Sabire Şöhret Aydemir3, Alper Tünger3, Mine Hoşgör-limoncu21Izmir Katip Celebi University, Faculty of Pharmacy, Department of Pharmaceutical Microbiology, Izmir, Turkey2Ege University, Faculty of Pharmacy, Department of Pharmaceutical Microbiology, Izmir, Turkey
3Ege University Faculty of Medicine, Department of Medical Microbiology, Izmir, Turkey
Objectives: The objectives of this study were to investigate the epidemiological relationship and prevalence of the beta-lactamase and virulence genes of clinical ampicillin resistant Salmonella enterica.
Materials and Methods: In vitro ampicillin susceptibilities of 117 Salmonella enterica isolates obtained between 2011-2012 from Ege University Hospital, Bacteriology Laboratory of Medical Microbiology Department were examined using disc diffusion method in accordance with CLSI. The MIC levels in the ampicillin resistant bacteria were determined by broth microdilution method. The resistant strains were serotyped by Public Health Institution. Epidemiological relations resistant strains were evaluated by using ERIC-PCR. Presence of beta-lactamase genes and virulence factors were detected by PCR.
Results: The 117 S. enterica strains had ten isolates which were resistant to ampicillin and MIC range of ampicillin were found as 512-128 μg/mL. Ampicillin resistant strains were susceptible to nalidixic acid, ciprofloxacin, cefotaxime, sulfamethoxazole/trimethoprim. Four different serotypes were identified and isolates were grouped into seven clusters. Five isolates carried blaTEM, two carried blaCTX-M gene. However, it was determined that blaSHV and blaPER genes were not exist in that strains. Virulence genes invA, pipD, sopB, were found in all isolates. sifA, pefA and sopE genes were found in seven, four, three isolates respectively.
Conclusion: Our data suggest that the rate of ampicillin resistance in S. enterica isolates is 8.5% in two year period, but this ratio is generally lower than the rates abroad. blaCTX-M and blaTEM genes could be responsible for ampicillin resistance. blaSHV gene which is highly prevelant in our country were not found in any strains. sopB and pipD genes that might be associated with beta-lactam resistance were found in all strains. It is also noteworthy that the three isolates containing the sopE gene which is associated with the epidemic cases were of the same serotypes and epidemiological clusters.
In 25th ECCMID 2015, Copenhagen, Denmark, was presented.
Klinik Salmonella izolatlarında antimikrobiyal duyarlılık profilinin, virülans genlerinin ve klonal ilişkinin araştırılması Kısa Başlık: Salmonella izolatlarında duyarlılık ve virülans
Yamaç Tekintaş1, Fethiye Ferda Yılmaz2, Sabire Şöhret Aydemir3, Alper Tünger3, Mine Hoşgör-limoncu21İzmir Katip Çelebi Üniversitesi, Eczacılık Fakültesi, Farmasötik Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, izmir, Türkiye2Ege Üniversitesi, Eczacılık Fakültesi, Farmasötik Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, izmir, Türkiye
3Ege Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, izmir, Türkiye
Amaç: Bu çalışmanın amacı ampisilin dirençli klinik Salmonella enterica izolatlarında epidemiyolojik ilişkinin, beta-laktamaz ve virülans genlerinin araştırılmasıdır.
Gereç ve Yöntmeler: Ege Üniversitesi Hastanesi Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı Bakteriyoloji Laboratuvarı’nda 2011-2012 yıllarında izole edilen S. enterica kökenlerinin ampisilin duyarlılıkları “Clinical and Laboratory Standarts Institute” (CLSI) önerileri doğrultusunda disk difüzyon yöntemiyle değerlendirildi. Ampisilin dirençli izolatlardaki ampisilin MİK değerleri yine CLSI kriterlerine göre sıvı mikrodilüsyon yöntemiyle belirlendi. Dirençli kökenler Türkiye Halk Sağlığı Kurumu tarafından serotiplendirildi. Kökenlerin epidemiyolojik ilişkisi ERIC-PZR ile incelendi. Beta-laktamaz ve virülans genlerinin prevalansı Polimeraz Zincir Reaksiyonu (PZR) ile tespit edildi.
Bulgular: İzole edilen 117 S. enterica kökeninde 10 izolat ampisilin dirençli olarak saptandı ve bu izolatların ampisilin MİK aralığı 512-128 μg/mL. olarak belirlendi. İzolatlar nalidiksik asit, siprofloksasin, sefotaksim ve sulfamethoksazol/trimethoprim antibiyotiklerine duyarlı bulundu. Dört farklı serotip belirlenirken, izolatlar ERIC-PZR’ ye göre 7 farklı epidemiyolojik grupta yer aldı. Kökenlerin 5 tanesinde blaTEM, iki tanesinde blaCTX-M geni saptandı. blaSHV ve blaPER genleri hiçbir izolatta saptanmadı. invA, pipD, sopB virülans genleri tüm kökenlerde belirlenirken, sifA, pefA and sopE genleri sırasıyla üç, dört ve yedi kökende belirlendi.
Sonuç: Verilerimiz, S. enterica izolatlarında iki yıllık dönemde ampisilin direnç oranının % 8,5 olduğunu ortaya koymakla birlikte bu oranın genel olarak yurtdışındaki oranlardan düşük olduğu göze çarpmaktadır. blaCTX-M ve blaTEM genleri ampisilin direncinden sorumlu olabilir. Ancak Ülkemizde oldukça yüksek oranda saptanan blaSHV genine hiçbir izolatta rastlanmamıştır. Βeta-laktam direnci ile ilişkili olabileceği düşünülen sopB ve pipD genleri tüm suşlarda bulunmuştur. Ayrıca epidemik vakalarla ilişkilendirilen sopE genini içeren üç izolatın aynı serotipe ve epidemiyolojik sınıfa ait kökenler olması dikkat çekicidir.
25th European Congress of Clinical Microbiology and Infectious Diseases (ECCMID) 25-28 April 2015, Copenhagen, Denmark, Kongresi'nde sunulmuştur.
Corresponding Author: Mine Hoşgör-limoncu, Türkiye
| TOOLS |
 Full Text PDF Print Download citation RIS EndNote BibTex Medlars Procite Reference Manager Share with email Share Send email to author
Similar articles Google Scholar |