Detection of gene localization in a large concomitant strabismus family
Kadriye Erkan Turan, Emin Cumhur Şener, Ali Şefik SanaçDepartment Of Ophthalmology, Hacettepe University, Ankara, TurkeyPurpose: To define the gene locus related with concomitant strabismus in a large exotropia family.
Method: A three-generation family including 31 individuals among which 17 members had basic exotropia and 3 members had intermittant exotropia with known genome wide analysis was conducted. The data of genome wide analysis was evaluated under the assumed pattern of autosomal dominant inheritance with incomplete penetrance which was supported by pedigree analysis. Detailed haplotype analysis of four regions on 3 chromosomes (chromosome 7, 13 and 18) which had positive lod scores in prior studies were performed.
Results: The first region on chromosome 13 was excluded regarding haplotype analysis but the second region could not be excluded because of the high homozigocity in the family. The region which had 200.000 bases on chromosome 18 could not be excluded as well. The region which had 9 megabase on 7p14.1 was common for all family members. 7p14.1 locus is considered as the most likely region responsible for the inheritance of strabismus in regard with familial inheritance and crossing-over pattern.
Conclusion: The 7p14.1 locus identified in this study is a novel site and it is different from the regions on chromosome 7 which were reported in prior studies. To the best of our knowledge, this is the initial study demonstrating the presence of critical recombinations across three generations and will shed light for further studies which will define the spesific gene.
Geniş bir konkomitan şaşılık ailesinde gen lokalizasyonunun saptanması
Kadriye Erkan Turan, Emin Cumhur Şener, Ali Şefik SanaçHacettepe Üniversitesi Tıp Fakültesi, Göz Hastalıkları Anabilim Dalı, AnkaraAmaç: Geniş bir ekzotropya ailesinde, konkomitan şaşılık ile bağlantılı gen bölgesini tanımlamak.
Yöntem: Genom boyu analizi bilinen, 17’sinde basit ekzotropya, 3’ünde intermitant ekzotropya bulunan, 3 kuşakta toplam 31 birey içeren bir aile çalışıldı. Genom boyu analizi verileri, pedigri analizi ile desteklenen eksik penetrans gösteren otozomal dominant kalıtım kalıbı varsayımı altında değerlendirildi. Pozitif lod (logarithm of odds) skor saptanan, üç farklı kromozomda (kromozom 7, 13 ve 18) 4 ayrı bölgeye detaylı haplotip analizi yapıldı.
Bulgular: Haplotip analizi sonucunda 13. kromozom üzerindeki ilk bölge tam olarak dışlanabildi, ancak 2. bölge ailedeki yüksek homozigotluk nedeniyle dışlanamadı. Ayrıca, 18. kromozom üzerindeki 200.000 baz büyüklüğündeki bir bölge de dışlanamadı. 7p14.1 lokusunda 9 Mb’lık bir bölgenin ise tüm aile bireylerinde ortak olarak kalıtıldığı saptandı. Aile bireylerinde gözlenen kalıtım ve crossing-over paterni dikkate alındığında, 7p14.1 bölgesi ailede şaşılığın kalıtımından sorumlu olan en muhtemel bölge olarak değerlendirildi.
Tartışma: 7p14.1 lokusu literatürde 7. kromozom üzerinde bildirilen bölgelerden farklı bir yerdedir ve yeni bir lokustur. Bu çalışma, 3 kuşak boyunca kritik rekombinasyonların gösterilebildiği ilk çalışmadır ve özgül genin belirlenmesine yönelik gelecek çalışmalar için ışık tutacaktır.
Corresponding Author: Kadriye Erkan Turan, Türkiye
| TOOLS |
 Print Download citation RIS EndNote BibTex Medlars Procite Reference Manager Share with email Share Send email to author
Similar articles Google Scholar |